Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERFP50548 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERFP50548 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms