Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATRXP46100 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATRXP46100 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATRXP46100 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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