Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR1BP42025 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms