Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms