Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.46■□□□□ 0.7
POLR2AP24928 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2AP24928 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2AP24928 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2AP24928 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2AP24928 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2AP24928 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2AP24928 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2AP24928 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2AP24928 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2AP24928 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2AP24928 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2AP24928 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
POLR2AP24928 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms