Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF3P18847 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF3P18847 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF3P18847 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF3P18847 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms