Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PTPRCP08575 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PTPRCP08575 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PTPRCP08575 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPRCP08575 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PTPRCP08575 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PTPRCP08575 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PTPRCP08575 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PTPRCP08575 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRCP08575 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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