Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF10O60809 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms