Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ZNF208O43345 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ZNF208O43345 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ZNF208O43345 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ZNF208O43345 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ZNF208O43345 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ZNF208O43345 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ZNF208O43345 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ZNF208O43345 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF208O43345 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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