Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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