Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLGNO14967 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLGNO14967 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLGNO14967 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLGNO14967 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLGNO14967 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLGNO14967 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLGNO14967 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLGNO14967 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLGNO14967 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLGNO14967 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLGNO14967 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLGNO14967 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLGNO14967 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms