Protein–RNA interactions for Protein: F5GYI3

UBAP1L, Ubiquitin-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1LF5GYI3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBAP1LF5GYI3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms