Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
STRCP1A6NGW2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms