Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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