Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMS3Q9UJD0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms