Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN11AQ9UI33 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms