Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms