Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC88CQ9P219 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms