Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VNN3Q9NY84 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms