Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHST11Q9NPF2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms