Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ELL3Q9HB65 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms