Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HIRIP3Q9BW71 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms