Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALPK3Q96L96 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALPK3Q96L96 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms