Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EP400Q96L91 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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