Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD2Q96BF3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms