Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI8

TMC1, Transmembrane channel-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC1Q8TDI8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMC1Q8TDI8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC1Q8TDI8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms