Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HJURPQ8NCD3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms