Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms