Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5B1Q2VPB7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms