Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYTH1Q15438 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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