Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NBR1Q14596 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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NBR1Q14596 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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NBR1Q14596 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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NBR1Q14596 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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NBR1Q14596 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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NBR1Q14596 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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NBR1Q14596 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NBR1Q14596 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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