Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR4Q13639 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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