Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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