Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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STRN3Q13033 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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STRN3Q13033 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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STRN3Q13033 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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STRN3Q13033 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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