Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FOXC1Q12948 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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