Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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KCNMA1Q12791 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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KCNMA1Q12791 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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KCNMA1Q12791 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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KCNMA1Q12791 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMA1Q12791 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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