Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COL16A1Q07092 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL16A1Q07092 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms