Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms