Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC10Q01780 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms