Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1BQ00975 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms