Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPK4P57078 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms