Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms