Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms