Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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PTPRZ1P23471 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PTPRZ1P23471 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PTPRZ1P23471 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PTPRZ1P23471 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PTPRZ1P23471 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PTPRZ1P23471 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRZ1P23471 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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