Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DSPP15924 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSPP15924 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSPP15924 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms