Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA4P13612 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms