Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALUO43852 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALUO43852 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALUO43852 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CALUO43852 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CALUO43852 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALUO43852 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALUO43852 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms