Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APAF1O14727 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APAF1O14727 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APAF1O14727 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APAF1O14727 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APAF1O14727 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APAF1O14727 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APAF1O14727 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APAF1O14727 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APAF1O14727 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms