Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms