Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TVP23AA6NH52 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TVP23AA6NH52 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms